肠道保健
1、防止腹泻：有益生菌帮忙，可以防止腹泻细菌病毒生长，有效防止腹泻问题。
2、改善便秘：益生菌产生有机酸，刺激肠道蠕动排出大便，有效改善便秘症状。
3、增进食欲：益生菌可以产生B族维生素和消化酶，促进食物消化吸收，提高宝宝食欲。
增强免疫
益生菌可以激活人体自身免疫系统产生免疫物质，防止细菌病毒感染，对于经常感冒发烧等免疫力低下的婴幼儿，服用之后，其免疫系统能更好的发育，抵抗力越来越强。
适用人群：
剖腹产儿
能从母亲产道获得益生菌，相反剖腹产儿由于有益菌的缺少，极易导致胃口差、挑食、偏食、厌食、便秘等现象。
非母乳喂养
母乳中含有益生菌，牛奶喂养儿比母乳喂养儿肠道中有害菌的比例要高很多，腐败梭菌、肠杆菌的检出率高，这也从其粪便的差异性反映出来。跟踪研究发现，这种有害菌比例较高的情况会导致孩子长大发生便秘、腹泻，远远高于母乳喂养儿。给非母乳喂养儿经常补充益生菌，就能减少非母乳喂养的不利影响。
抗生素
主要是由于抗菌药不能识别有害菌和有益菌，它在杀死致病菌的同时，也杀死了有益菌，导致肠道菌群失调。美国的Nancu T. Williams教授于2010年明确指出，益生菌制剂与口服抗菌药联用时，应在服用抗菌药后至少2小时再服用益生菌制剂。其原因是2小时后抗菌药基本入血，避免了抗菌药与益生菌直接接触，影响益生菌的活性。
食物过敏
在防治食物过敏性疾病方面唯独益生菌疗法备受青睐。因为益生菌可通过分泌γ-干扰素、IL-10和TGF-β等细胞因子，以调控机体的免疫应答，恢复免疫系统的动态平衡，有效防治过敏性疾病。
益生菌及其产物通过肠道内壁激活免疫细胞，促进肠粘膜分泌免疫球蛋白（SlgA），这些被益生菌激活的免疫细胞游走到全身，可维持机体全身免疫力处于正常状态。当幼儿体内的益生菌减少时，免疫力也会发生失衡，临床表现为“体质弱、反复生病”。
发育不良
益生菌会促进肠道内各种消化酶的产生，特别是乳糖酶，加快牛奶中主要成分乳糖的分解和吸收；同时，益生菌也能产生维生素β和维生素κ等营养物质，促进钙、铁、锌等微量元素的吸收。如果孩子体内的益生菌减少了，就可能会出现生长发育不良的状况。
肥胖儿
美国科研人员在《Nature》公布的一项研究成果称，菌群失调是造成肥胖者体重增加的重要原因之一。“控制”消化系统内的细菌，可达到减肥的效果。《Nature》杂志肯定了这一研究，称之为“革命性的想法”。
另外，建议最好在宝宝半岁左右及断奶期和上幼儿园时能补充一段时间的益生菌。因为宝宝在半岁时，体内的抗体少，这时抵抗力会比较差，容易受到感染。如果此时及时补充益生菌可以更好的提高抵抗力，起到预防疾病的作用。同时，随着婴幼儿的成长，开始吃各种辅食，特别是在断奶后基本上都是吃固体饮食了，会引起肠道内菌群的变化，上幼儿园后接触人群的增多也会增加感染几率，所以断奶期和上幼儿园时也应该补充。
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